如果你使用了 Gulp 的 gulp-include 插件来包含模块，并且在修改模块文件时没有触发更新，可能是因为 Gulp 默认会根据文件的修改时间（timestamp）来判断是否需要更新，而这对于被包含的模块文件可能不起作用。

一种解决方法是使用 gulp-changed 插件，它会比较文件内容而不仅仅是修改时间。以下是一个可能的 Gulp 配置：

首先，确保你已经安装了 gulp-changed：

npm install gulp-changed --save-dev
然后，在你的 gulpfile.js 文件中，将 gulp.src 中的路径修改为模块文件的路径，而不是主 main.js 文件：
const gulp = require('gulp');
const changed = require('gulp-changed');
const include = require('gulp-include');
const paths = {
  scripts: 'src/**/*.js', // 修改为模块文件的路径
  dest: 'dist'
};
gulp.task('scripts', function() {
  return gulp.src(paths.scripts)
    .pipe(changed(paths.dest))
    .pipe(include()) // 使用 gulp-include 处理模块
    .pipe(gulp.dest(paths.dest));
});
gulp.task('watch', function() {
  gulp.watch(paths.scripts, gulp.series('scripts'));
});
gulp.task('default', gulp.series('scripts', 'watch'));

在这个配置中，我们将 gulp.src 的路径修改为模块文件的路径，然后使用 gulp-changed 来比较文件内容。接着，我们使用 gulp-include 插件来处理模块。

这样，当模块文件发生变化时，构建任务应该会正确更新。如果问题仍然存在，请确保模块文件的路径正确，并检查是否安装了必要的 Gulp 插件。